MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY050

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016029	CT	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
2	NC_016029	CGC	2	6	99	104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
3	NC_016029	CCT	2	6	188	193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
4	NC_016029	CTCTC	2	10	196	205	0 %	40 %	0 %	60 %	347662275
5	NC_016029	CCG	2	6	330	335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
6	NC_016029	CTC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
7	NC_016029	AG	3	6	428	433	50 %	0 %	50 %	0 %	347662275
8	NC_016029	TGG	2	6	485	490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347662275
9	NC_016029	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347662275
10	NC_016029	CTG	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662275
11	NC_016029	ACT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
12	NC_016029	GCA	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
13	NC_016029	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
14	NC_016029	CA	3	6	654	659	50 %	0 %	0 %	50 %	347662275
15	NC_016029	GCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
16	NC_016029	CT	3	6	710	715	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
17	NC_016029	CCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662275
18	NC_016029	CGC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
19	NC_016029	TC	3	6	876	881	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
20	NC_016029	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
21	NC_016029	TC	3	6	1065	1070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016029	AGC	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016029	CTT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016029	GACA	2	8	1270	1277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016029	CAGA	2	8	1312	1319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016029	GCC	3	9	1396	1404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662276
27	NC_016029	AG	3	6	1408	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	347662276
28	NC_016029	GCA	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662276
29	NC_016029	ACA	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662276
30	NC_016029	GCCCT	2	10	1660	1669	0 %	20 %	20 %	60 %	347662276
31	NC_016029	TCT	2	6	1728	1733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016029	AGT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016029	T	6	6	1902	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016029	T	7	7	1924	1930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016029	T	6	6	1945	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016029	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016029	A	6	6	1974	1979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016029	AG	3	6	1981	1986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016029	CT	3	6	2026	2031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016029	TGTC	2	8	2039	2046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016029	G	6	6	2123	2128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016029	GAA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347662277
43	NC_016029	CTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
44	NC_016029	AGG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
45	NC_016029	AAC	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662277
46	NC_016029	TGC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
47	NC_016029	AGG	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
48	NC_016029	ATC	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662277
49	NC_016029	GAA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016029	CTTC	2	8	2674	2681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016029	CTA	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016029	GT	4	8	2747	2754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016029	CCT	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016029	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016029	CAAAA	2	10	2899	2908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016029	A	7	7	2905	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016029	TA	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016029	AT	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
59	NC_016029	CTT	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347662278
60	NC_016029	TTTTCA	2	12	2978	2989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347662278
61	NC_016029	TTTA	2	8	3012	3019	25 %	75 %	0 %	0 %	347662278
62	NC_016029	AT	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
63	NC_016029	AAT	2	6	3092	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347662278
64	NC_016029	TA	3	6	3102	3107	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
65	NC_016029	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	347662278
66	NC_016029	ATT	2	6	3153	3158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347662278
67	NC_016029	CAA	2	6	3165	3170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662278
68	NC_016029	TCTT	2	8	3210	3217	0 %	75 %	0 %	25 %	347662278
69	NC_016029	T	7	7	3216	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	347662278
70	NC_016029	ATTT	2	8	3254	3261	25 %	75 %	0 %	0 %	347662278
71	NC_016029	GAAA	2	8	3262	3269	75 %	0 %	25 %	0 %	347662278
72	NC_016029	TGT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016029	ACA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016029	A	7	7	3372	3378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016029	T	6	6	3386	3391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016029	T	7	7	3394	3400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016029	CAT	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016029	T	6	6	3459	3464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016029	T	6	6	3466	3471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016029	CTT	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016029	AGA	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016029	A	6	6	3529	3534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016029	C	6	6	3536	3541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_016029	AGTT	2	8	3567	3574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016029	GCGG	2	8	3604	3611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016029	CGTGCA	2	12	3643	3654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016029	AAAC	2	8	3658	3665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016029	A	6	6	3679	3684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016029	A	6	6	3729	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016029	TAC	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016029	ATTT	2	8	3806	3813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016029	CT	3	6	3900	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016029	CCA	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662279
94	NC_016029	TGTC	2	8	4055	4062	0 %	50 %	25 %	25 %	347662279
95	NC_016029	GGC	2	6	4079	4084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347662279
96	NC_016029	CTG	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
97	NC_016029	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
98	NC_016029	GCC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662279
99	NC_016029	ACG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662279
100	NC_016029	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016029	GTC	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016029	GAA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016029	CGT	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016029	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016029	GA	3	6	4603	4608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.